În spatele fiecărui buletin de analiză stau o serie de aparate care separă componentele probelor analizate. Prin tehnicile de separare utilizate se face identificarea componenților și determinarea cantitativă a acestora. Două dintre cele mai folosite tehnici de separare sunt prezente și în laboratoarele ANF, și anume: cromatografia de gaze (GC) și cromatografia de lichide (LC/HPLC).